Première saison
   1 (1-01) : TeddyGozilla (Teddygozilla) (03/09/03)
   2 (1-02) : Le Voir pour le Croire (Seeing Is Believing) (10/09/03)
   3 (1-03) : Vacances dans la Brume (Holidays in the Fog) (17/09/03)
   4 (1-04) : Carnet de Bord (Log Book) (31/09/03)
   5 (1-05) : Big Bogue (Big Bug) (01/10/03)
   6 (1-06) : Cruel dilemme (Cruel Dilemma) (08/10/03)
   7 (1-07) : Problème d'Image (Image Problem) (15/10/03)
   8 (1-08) : Clap de Fin (End of Take) (22/10/03)
   9 (1-09) : Satellite (Satellite) (29/10/03)
  10 (1-10) : Créature de Rêve (The Girl of the Dreams) (05/11/03)
  11 (1-11) : Enragés (Plagued) (12/11/03)
  12 (1-12) : Attaque en Piqué (Swarming Attack) (19/11/03)
  13 (1-13) : D'Un Cheveu (Just in Time) (26/11/03)
  14 (1-14) : Piège (The Trap) (03/12/03)
  15 (1-15) : Crise de Rire (Laughing Fit) (10/12/03)
  16 (1-16) : Claustrophobie (Claustrophobia) (17/12/03)
  17 (1-17) : Mémoire Morte (Amnesia) (24/12/03)
  18 (1-18) : Musique Mortelle (Killer Music) (31/12/03)
  19 (1-19) : Frontière (Frontier) (07/01/04)
  20 (1-20) : L'Âme des Robots (The Robots) (14/01/04)
  21 (1-21) : Gravité Zéro (Zero Gravity Zone) (21/01/04)
  22 (1-22) : Routine (Routine) (28/01/04)
  23 (1-23) : 36e dessous (Rock Bottom) (04/02/04)
  24 (1-24) : Canal Fantôme (Ghost Chanel) (11/02/04)
  25 (1-25) : Code Terre (Code Earth) (18/02/04)
  26 (1-26) : Faux Départ (False Start) (25/02/04)
Deuxième saison
  27 (2-01) : Nouvelle Donne (New Order) (31/08/05)
  28 (2-02) : Terre Inconnue (Unchartered Territory) (07/09/05)
  29 (2-03) : Exploration (Exploration) (14/09/05)
  30 (2-04) : Un Grand Jour (A big Day) (21/09/05)
  31 (2-05) : Mister Pück (Mister Pück) (28/09/05)
  32 (2-06) : Saint Valentin (Valentine's Day) (05/10/05)
  33 (2-07) : Mix Final (Final mix) (12/10/05)
  34 (2-08) : Chaînon Manquant (Missing Link) (19/10/05)
  35 (2-09) : Les Jeux sont Faits (The Chips Are Down) (26/10/05)
  36 (2-10) : Marabounta (Marabounta) (02/11/05)
  37 (2-11) : Intérêt commun (Common Interest) (09/11/05)
  38 (2-12) : Tentation (Temptation) (07/12/05)
  39 (2-13) : Mauvaise Conduite (A Bad Turn) (16/11/05)
  40 (2-14) : Contagion (Attack of the Zombies) (23/11/05)
  41 (2-15) : Ultimatum (Ultimatum) (30/11/05)
  42 (2-16) : Désordre (A Fine Mess) (14/12/05)
  43 (2-17) : Mon Meilleur Ennemi (Xana's Kiss) (11/01/06)
  44 (2-18) : Vertige (Vertigo) (11/01/06)
  45 (2-19) : Guerre Froide (Cold War) (18/01/06)
  46 (2-20) : Empreintes (Déjà Vu) (18/01/06)
  47 (2-21) : Au Meilleur de sa Forme (Tip-Top Shape) (25/01/06)
  48 (2-22) : Esprit Frappeur (Is Anybody Out There?) (25/01/06)
  49 (2-23) : Franz Hopper (Franz Hopper) (01/02/06)
  50 (2-24) : Contact (Contact) (01/02/06)
  51 (2-25) : Révélation (Revelation) (08/02/06)
  52 (2-26) : Réminiscence (The Key) (08/02/06)
Troisième saison
  53 (3-01) : Droit au Cœur (Straight to Heart) (09/09/06)
  54 (3-02) : Lyoko Moins 1 (Lyoko Minus One) (16/09/06)
  55 (3-03) : Raz de Marée (Tidal Wave) (23/09/06)
  56 (3-04) : Fausse Piste (False Lead) (30/09/06)
  57 (3-05) : Aelita (Aelita) (07/10/06)
  58 (3-06) : Le Prétendant (The Pretender) (14/10/06)
  59 (3-07) : Le Secret (The Secret) (21/10/06)
  60 (3-08) : Une Tarentule au Plafond (Temporary Insanity) (01/11/06)
  61 (3-09) : Sabotage (Sabotage) (02/11/06)
  62 (3-10) : Désincarnation (Nobody in Particular) (03/11/06)
  63 (3-11) : Triple Sot (Triple Trouble) (06/11/06)
  64 (3-12) : Surmenage (Double Trouble) (07/11/06)
  65 (3-13) : Dernier Round (Final Round) (08/11/06)
Quatrième saison
  66 (4-01) : Renaissance (William Returns) (13/08/07)
  67 (4-02) : Mauvaise Réplique (Double Take) (14/08/07)
  68 (4-03) : Première Partie (Opening Act) (30/08/07) Sur Codelyoko.com
  69 (4-04) : Double Foyer (Wreck Room) (15/08/07)
  70 (4-05) : Skidbladnir (Skidbladnir) (16/08/07)
  71 (4-06) : Premier Voyage (Maiden Voyage) (17/08/07)
  72 (4-07) : Leçon de Choses (Crash Course) (20/08/07)
  73 (4-08) : Réplika (Replika) (21/08/07)
  74 (4-09) : Je préfère ne pas en parler ! (I'd Rather Not Talk About It) (22/08/07)
  75 (4-10) : Corps célèste (Hot Shower !) (23/08/07)
  76 (4-11) : Le Lac (The Lake) (24/08/07)
  77 (4-12) : Torpilles Virtuelles (Lost at Sea) (27/08/07)
  78 (4-13) : Expérience (Lab Rat) (28/08/07)
  79 (4-14) : Arachnophobie (Bragging Rights) (29/08/07)
  80 (4-15) : Kiwodd (Dog Day Afternoon) (29/08/07)
  81 (4-16) : Oeil pour Oeil (A Lack of Goodwill) (30/08/07)
  82 (4-17) : Mémoire Blanche (Distant Memory) (31/08/07)
  83 (4-18) : Superstition (Hard Luck) (08/09/07)
  84 (4-19) : Missile Guidé (Guided Missile) (15/09/07)
  85 (4-20) : La Belle de Kadic (Kadic Bombshell) (22/09/07)
  86 (4-21) : Kiwi Superstar (Canine Conundrum) (29/09/07)
  87 (4-22) : Planète Bleue (A Space Oddity) (06/10/07)
  88 (4-23) : Cousins Ennemis (Cousins Once Removed) (13/10/07)
  89 (4-24) : Il est sensé d'être insensé (Music Soothes the Savage Beast) (20/10/07)
  90 (4-25) : Médusée (Wrong Exposure) (27/10/07)
  91 (4-26) : Mauvaises Ondes (Bad Connection) (03/11/07)
  92 (4-27) : Sueurs Froides (Cold Sweat) (03/11/07)
  93 (4-28) : Retour (Down to Earth) (03/11/07)
  94 (4-29) : Contre-Attaque (Fight to the Finish) (10/11/07)
  95 (4-30) : Souvenirs (Echoes) (10/11/07)

Liste réalisée avec l’aide de Wikipédia, notamment pour les titres anglais des épisodes.